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科學城東區規劃面積32.5平方公里，重點聚焦地球科學、生命健康、氣候經濟等領域，加速成為世界級原始創新承載區。目前，地球系統數值模擬裝置、5個交叉平臺項目（深部資源探測技術裝備研發平臺、京津冀大氣環境與物理化學前沿交叉研究平臺、環境污染物識別與控制協同創新平臺、泛第三極環境綜合探測平臺、清華大學空地一體環境感知與智慧響應研究平臺）已經陸續投入運營，北京大學懷密醫學中心、北京第二實驗學校等項目，正在規劃建設。
中關村密雲園規劃面積19.44平方公里，其中，密雲經濟開發區規劃面積12.5平方公里、密雲生態商務區規劃面積6.94平方公里。中關村密雲園成為全區經濟發展的主陣地。是密雲經濟建設的主戰場、科技創新的策源地、科學城成果轉化的承載區，圍繞醫藥健康、智慧製造、生態環保、資訊技術四個重點産業方向，打造大健康産業聚集區，建設生命健康産業園；打造智慧製造産業聚集區，建設科技成果轉化産業園；打造節能環保産業聚集區；大力發展科技服務業。
密雲區國家現代農業産業園總佔地面積407平方公里，圍繞東邵渠鎮、河南寨鎮、巨各莊鎮、穆家峪鎮四個鎮建立産業園園區，以特色果品、精品蔬菜為主導産業，打造“1+3+N”的總體空間佈局，即“1”個蔡家洼核心區，北京極星現代農業科技園、匯源密雲農谷、邑仕山谷葡萄溝示範園組成的“3”個高效農業創新中心，“N”個果蔬生産基地。
