五号线可与多条轨道线路实现换乘，包括10号线一期的惠新西街南口站、2号线的崇文门站、雍和宫站、1号线东单站、13号线的立水桥站，同时预留了10线二期的宋家庄站、亦庄线的宋家庄站、6号线的东四站，此外，本市远期规划中的7号线将与5号线在磁器口附近实现通道换乘。