应以局部点药为主，常用的药有0.1%利福平眼药水，0.25%氯霉素眼药水、氧氟沙星滴眼剂，要长期点药，不能间断，一般需要点眼1～3个月，严重的应持续更长时间。
沙眼重在预防。一方面对沙眼病人，要积极治疗，另外在容易流行的单位、场所建立消毒隔离制度，特别是玩具、毛巾、枕巾要定期消毒。有条件的尽量用流动水洗脸、洗衣，减少交叉感染的机会，教育儿童养成勤洗手、不揉眼的良好习惯。
